Si cuando intentas ver tu aplicación de Ajax en Internet Explorer te marca un error de JavaScript que dice:

'Sys.Debug.isDebug' es nulo o no es un objeto

En inglés:

'Sys.Debug.isDebug' is null or not an object

lo más probable es que no has instalado las últimas extensiones. Haz lo siguiente:

1. Desinstala las Extensiones de Ajax
2. Reinicia el IIS
3. Descarga e instala las Extensiones de Ajax más nuevas de www.asp.net
4. Reinicia el IIS

Todo debe funcionar después de estos pasos.

Si no es así, quizás debas revisar tu código ya que han habido algunos cambios a lo largo de la historia de Ajax.